Církev měla být podle představ Josefa II. zmodernizována, protože její majetek byl málo produktivní a málo zdaněný. Zrušil řadu svátků, poutí a procesí, protože bránily rozvoji ekonomiky. Rušil kláštery, které neměly školský a charitativní význam a pro společnost nebyly užitečné, třeba kláštery rozjímavých a žebravých řádů. Z jejich majetku založil náboženský fond.