Níže pod Velkou věží byl pětipodlažní Císařský palác a nejníže byly vybudovány provozní části předhradí, Purkrabský dům a Studniční věž. Ta měla 80 metrů hlubokou studnu, z níž se voda čerpala pomocí šlapacího kola, uvnitř kterého chodili lidé. Otáčením se během deseti minut vytahoval či spouštěl okov o obsahu 70 litrů. Studna byla zásobována pomocí podzemní štoly vodou z potoka, který obtékal hradní skálu na západní straně.
Případný dobyvatel měl mizivou šanci hrad dobýt. Například v roce 1422 ho obléhali neúspěšně pět měsíců husité. Na Karlštejn vystřelili přes 10000 střel, mezi nimi i 22 soudků s ohněm a téměř 2000 soudků s obsahem pražských žump, vrhaných na hrad pomocí velkých praků. Vše zbytečně.